Po utworzeniu profilu, co dalej? To zależy od tego, w jaki sposób profil DNA ma być stosowany. Jeśli został stworzony z DNA odzyskanych w ramach dochodzenia karnego, prokuratura w Stanach Zjednoczonych będzie wprowadzić go w CODIS, system Index połączonych danych. CODIS to program komputerowy, prowadzonego przez FBI, która działa do baz danych w całym kraju. Bazy te zawierają ponad pięć milionów profili. CODIS zawiera kilka różnych indeksów:
.
CODIS wykorzystuje algorytmy porównać 13 różnych miejsc STR, plus jeden, który określa płeć danej osoby. Ma zasady i zabezpieczenia w celu ochrony prywatności osób, których profile znajdują się w bazie danych. Algorytmy dopasowania - które muszą być potwierdzone przez analityka - może produkować potencjalnych klientów dla organów ścigania, a nawet zidentyfikować potencjalnego napastnika. Minusem korzystania CODIS jest to, że jest tak mocny, jak liczba profili włączone i nie ma zaległości w kilku miliona profili mają być wprowadzone. Największa
Prokuratorzy mogą także korzystać z ekspertów DNA w celu dopasowania profili podczas budowania przypadki gdzie istnieje wysoki stopień pewności napastnika. Jednak profilowanie DNA jest używany bardziej dla osób skazanych przed jej wspólnego użytku, który rozpoczął się pod koniec 1980 roku. Od początku 1990 roku skazani przestępcy są w stanie korzystać z najnowszych technologii p
