W 2003 roku nastąpiła kolejna zmiana obserwowana. W tym roku Coast Guard został przeniesiony z Ministerstwa Transportu do nowo utworzonego Departamentu Bezpieczeństwa Wewnętrznego. Nacisk do Departamentu Bezpieczeństwa Wewnętrznego był na ochronę kraju przed terroryzmem. Największa
i zabraniano wstępu do Stanów Zjednoczonych nielegalnie przez Coast Guard od 1992 do 1994. Ponadto, Coast Guard świadczone usługi w czasie wojny w Zatoce Perskiej w 1991 roku i wojny w Iraku, która rozpoczęła się w 2003 roku
