Jako dyrektor NHGRI, Collins nadzoruje Stany Zjednoczone rolę w Human Genome Project, międzynarodowego wysiłku mapowania ludzkiego genomu ( kompletny zestaw genów w komórce). The Human Genome Project rozpoczęła się w 1990 roku jako program do określenia całego zestawu instrukcji chemicznych, które kontrolują dziedziczności u ludzi i niektórych innych organizmów. Naukowcy uważają, że dzięki zrozumieniu ludzkiego genomu, będą w stanie lepiej znaleźć i zrozumieć związek między genami i choroby. Wiedza ta zapoczątkuje rewolucję w dziedzinie medycyny. Doprowadzi to do zindywidualizowanej medycyny prewencyjnej, w której ludzie będą wykonać test genetyczny, a następnie otrzymywać leków lub terapii profilaktycznej w oparciu o ich osobistej genetycznej. Doprowadzi to również do opracowania bardziej skutecznych leków i terapii w oparciu o głębsze zrozumienie mechaniki choroby. Największa
Oprócz mapowania ludzkiego genomu, projekt ma również na celu opracowanie technologii, które pomogą naukowcom a lekarze w analizowanie informacji otrzymał od badań genetycznych. Projekt promuje także szkolenia korpus naukowców do wykorzystania tej technologii i zasobów opracowanego w ramach projektu w sposób, w celu poprawy zdrowia ludzkiego. Największa
Kolejnym ważnym elementem Human Genome Project to badanie możliwe etycznych, społecznych, oraz kwestie prawne, które mogą wynikać z badania ludzkiego genomu. Collins był w czołówce takich zagadnień, do których należą kwestie, jak ludzie będą korzystać z własnych informacji genetycznych i informacji genetycznej innych. Największa
Collins stara się również zapewnić publiczny dostęp do wyników projektu, tak, że naukowcy na całym świecie mogą używać go do postępu wiedzy o genetycznych? oraz jej praktycznego zastosowania. 
[1] [2]