Dwa lata po publikacji O powstawaniu gatunków, Bates, poczytać gazetę, "Składki na owada fauny Amazon Valley," do Linnean Society (przed którym Darwin pierwszy wyłożył swoje poglądy w 1858 roku). W artykule przedstawiono odkrycie Bates, że kilka różnych gatunków motyli mają niemal identyczne wzory kolorów na swoich skrzydłach, z których tylko niektóre odstraszają drapieżniki ptaków. Bates twierdził, że dobór naturalny i przetrwanie najsilniejszych spowodowane motyle skrzydła naśladować wzory, które zwiększają szanse przeżycia. Przed Bates opublikował swój papier, inne przyrodnicy zauważył podobieństwo wzorców kolorów wśród pewnych grup motyli zamieszkujących ten sam obszar geograficzny. Bates był pierwszym, który oferuje pełne wyjaśnienie naukowe dla niego. Zjawisko to, zwane teraz Batesian mimika, w pełni potwierdzone Darwina teorię doboru naturalnego. Wykorzystując dane Batesa, Darwin był w stanie obalić swoich krytyków w krótkim, unsigned przeglądu w Review of Natural History 1863
W 1863 roku, Bates opublikowane przyrodnika na Amazonki, w którym opisał zarówno wyprawę i jego odkrycia naukowe. Największa
W 1864 roku, Bates został asystentem sekretarza Royal Geographical Society w Londynie, piastował przez 28 lat. Redagował swój dziennik i postępowanie i pracował jako konsultant lub asystenta do innych czasopism naukowych, w tym The entomolog. Bates przyczyniły się ponad 100 prac naukowych na temat entomologii do czasopism naukowych, które przyniosły mu światową sławę jako wybitny autorytet w Coleoptera, zlecenia obejmującego chrząszcze. Największa