W wyborach prezydenckich w 1800 roku doszło do impasu pomiędzy Jefferson i Aaron Burr. Mimo, że nie jest przyjacielem Jefferson, Hamilton preferowany go do Burr, i rzucił jego wpływ na jego stronę. W rezultacie, Jefferson został prezydentem i Burr wiceprezes. W 1804 roku, podczas gdy jeszcze Wiceprezesa, Burr biegł na gubernatora Nowego Jorku. W trakcie kampanii, Hamilton złożyli oświadczenia atakujące charakter Burr jest. Hamilton Burr wyzwał na pojedynek. Obaj wymienili strzały 11 lipca w Weehawken, New Jersey. Hamilton został śmiertelnie ranny i zmarł następnego dnia. Został pochowany na cmentarzu w Trinity, New York City. Największa
Papiery Alexander Hamilton (27 tomów) zostały opublikowane od 1916 roku do 1987 roku