Pod koniec 1953 roku, Oppenheimer został oskarżony o zagrożenie dla bezpieczeństwa Stanów Zjednoczonych i, w grudniu 1953 roku, jego poświadczenia bezpieczeństwa został zawieszony. Oppenheimer dano możliwość rezygnacji z GAC lub mieć rozprawę. Oppenheimer odmówił rezygnacji i zażądał przesłuchania. W ciągu 1954 przesłuchań wielu naukowców i urzędników publicznych potwierdziła wierność Oppenheimer jest. Niemniej jednak, w dniu 27 maja 1954 roku, zarząd odmówił przywrócenia bezpieczeństwa poświadczenie bezpieczeństwa Oppenheimer, nawet jak się przyznał, jego lojalność. Chociaż AEC natychmiast rozwiązał umowę z nim, dziewięć lat później uhonorowało go nagrodą jego Enrico Fermi. Największa
Oprócz nadal kierować Institute for Advanced Study, Oppenheimer napisał wiele książek w ciągu najbliższych lat , w tym nauka i wspólne zrozumienie (1954), The Open Mind (1955) i The Flying Trapeze. Trzy kryzysy dla Fizyków (1964)
W 1994 roku, emerytowany KGB (NKWD) ogólnie twierdził w swojej autobiografii, że Oppenheimer przekazał tajemnice atomowe do Związku Radzieckiego. Ponieważ pamiętnik pełen jest błędów, społeczność naukowa w ogóle nadal uważa, że Oppenheimer nigdy świadomie nie zdradził swój kraj. Największa