W 1928 roku dołączył do Condon Columbia University jako wykładowca fizyki. W tym samym roku został asystentem profesora fizyki na Uniwersytecie w Princeton. W następnym roku wykładał fizykę na Uniwersytecie w Minnesocie. Wrócił do Kolumbii w 1930 roku, gdzie pozostał aż do 1937 roku
Condon opracowany większość swoich oryginalnych wkładów do rozwoju fizyki teoretycznej, podczas gdy w Princeton. Jego interpretacja wysokiej energii rozpraszania protonów wyjaśnił jądrowej dużej siły, która stanowiła podstawę współczesnej teorii atomowej i dramatycznie wpływ na rozwój badań w dziedzinie energii atomowej. On również wkład w spektroskopii masowej cząsteczek oraz w zrozumieniu kwantowej mechanicznej podstawie drgań molekularnych wycenianych metodą spektroskopii w podczerwieni i rotacji światła przez cząsteczki. Największa
W 1937 roku przeniósł się do Pittsburgha Condona do przyłączenia się do Westinghouse Electric Manufacturing Corporation i dyrektor stowarzyszonym badań. Pomógł doprowadzić firmę do ery nuklearnej poprzez poprawę i koncentrując podstawowe programy badań jądrowych. Na początku 1940 roku, był konsultantem do Komitetu Badań Obrony Narodowej i pomógł rozwinąć powietrzu systemów radarowych do użytku w II wojnie światowej (1939-1945). On także pomógł znaleźć Pracowni Radiologicznej w Massachusetts Institute of Technology (MIT). Również na początku 1940 roku, Robert Oppenheimer mianowany Condon współpracownik dyrektor ówczesnego tajnego laboratorium Los Alamos, gdzie stosowane pracę na spektroskopii masowej do rozdzielania izotopów uranu do broni atomowej. Od 1943-1945 pracował w Laboratorium Promieniowania w Berkeley na spektrometrii masowej separacji izotopów uranu do bomby atomowej. Po wojnie, Condon rozpoczął pisanie i mówienie w celu uświadamiające ludziom decyzji politycznych co do celów wojskowych energii atomowej. Wierzył, że cywilna kontrola nad rozwojem i produkcją broni jądrowej było jednym z kluczy do uniknięcia wojny nuklearnej. Największa
W 1945 roku został dyrektorem Narodowego Biura Standardów i pracował jako doradca nauk
