Kiedy portugalscy kupcy pierwszy odwiedził Borneo w 16 wieku, sułtan Brunei wykluczyć większość północnym wybrzeżu wyspy. Reszta Borneo było pod rządami lokalnych książąt. Portugalczycy, a później Holendrzy i Brytyjczycy, handlowali z Borneo w ciągu 17 i 18 wieku, ale Europejczycy się nie duży wpływ aż do połowy 1880 roku. W 1841 roku James Brooke, Anglika, powstał Radża Sarawak przez sułtana Brunei, w zamian za pomoc w eliminacji piractwa i tłumić zbuntowanych plemion. Holenderski kontrola powstała na obszarach południowej Borneo od 1850 roku. Brytyjczycy szybko rozszerzyli kontrolę, ograniczenie Sułtanatu Brunei małej enklawy na północnym wybrzeżu. Największa
W 1888 Brunei, Sarawak i Borneo Północne stał brytyjskie protektoraty. Cztery lata później granica została ustalona między brytyjskich i holenderskich posiadłości na wyspie. Podczas II wojny światowej niektórych obszarach przybrzeżnych Borneo były zajęte przez Japończyków. W 1946 Sarawak i Borneo Północne zostały wykonane kolonie brytyjskie, ale pozostał w Brunei Brytyjskie chronionych sułtanat. Holenderski połączyła się z Borneo, Sumatra i Jawa Madura, w 1949 roku, tworząc Indonezja. Największa
W 1963 Sarawak i Borneo Północne (przemianowany Sabah) dołączył Malaya i Singapur w tworzeniu niezależnego kraju Malezji. Opozycja Indonezji do stworzenia Malezji doprowadziły do konfliktu zbrojnego na Borneo; Walka zakończyła się w 1966. Brunei uzyskała niepodległość w 1984 roku